Detailed information of deep learning profile BP001370.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF436 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF436
Model ID: BP001370.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0324.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9C0F3  
Source: ENCSR335SUD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.02 0.03 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.03 0.02 -0.00 0.04 0.02 -0.00 0.03 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.04 0.01 -0.00 0.03 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.05 -0.00 -0.00 0.06 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 167 149 373 258 160 154 153 453 460 507 179 222 123 21 560 18 5 64 23 14 30 20 35 837 96 20 866 983 4 29 28 29 41 11 44 158 145 105 639 72 80 233 127 161 154 196 283 193 163 194 ]
C [ 373 509 272 268 467 273 505 297 204 184 235 141 521 830 102 1037 908 24 1061 952 44 1003 972 40 27 5 151 36 0 804 1023 541 100 1027 904 490 71 86 221 411 285 294 682 543 565 507 296 331 455 420 ]
G [ 160 175 222 403 228 209 167 185 292 283 227 655 80 46 266 15 17 60 2 13 34 22 13 167 891 1067 66 47 1081 87 11 33 99 14 41 143 387 851 131 81 143 290 115 103 147 190 253 314 242 203 ]
T [ 396 263 229 167 241 460 271 161 140 122 455 78 372 199 168 26 166 948 10 117 988 51 76 52 82 4 13 30 11 176 34 493 856 44 107 305 493 54 105 532 588 279 172 289 230 203 264 258 236 279 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.02 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 0.03 0.03 -0.02 -0.00 -0.00 -0.02 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.03 0.03 0.02 -0.02 0.04 0.02 -0.02 0.03 0.03 -0.00 -0.01 -0.04 0.01 0.00 -0.04 0.01 0.04 0.02 -0.02 0.03 0.02 -0.00 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.05 -0.02 -0.00 -0.02 -0.02 0.01 0.03 0.05 -0.02 -0.01 0.06 -0.01 -0.03 -0.00 0.01 -0.03 -0.01 0.01 0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 0.00 0.02 -0.01 0.00 0.03 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.00 -0.00 ]