Detailed information of deep learning profile BP001369.1

  1. Home
  2. Deep Learning Profile > BP001369.1
This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF460 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF460
Model ID: BP001369.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1596.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q14592  
Source: ENCSR261UIH
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

 

Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.03 0.00 0.04 0.03 0.04 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.04 0.07 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 0.06 0.00 0.03 0.00 0.01 0.00 0.02 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 386 1739 8034 261 196 245 1183 109 240 194 2086 139 86 77 104 6240 81 14 8 12 4 9 3 6117 8510 3217 75 5686 298 16 94 612 426 385 8669 72 65 8618 56 8761 191 49 85 1763 72 1049 3104 2406 19 27 ]
C [ 4070 1356 166 392 3882 7390 481 7878 7864 3330 241 8067 8104 225 7254 89 76 8898 8843 22 8913 8768 8926 158 88 61 250 69 64 8708 100 25 70 84 32 3091 367 32 8711 29 19 23 4766 122 3620 2215 4782 98 8707 8878 ]
G [ 503 5484 497 151 129 168 1682 153 280 166 6385 130 139 57 125 2434 8734 11 7 7 4 3 0 2473 248 5607 3036 96 8527 39 46 8248 8319 8364 184 62 73 254 30 105 8672 8837 149 6922 173 5517 45 6375 29 6 ]
T [ 3975 355 237 8130 4727 1131 5588 794 550 5244 222 598 605 8575 1451 171 43 11 76 8893 13 154 5 186 88 49 5573 3083 45 171 8694 49 119 101 49 5709 8429 30 137 39 52 25 3934 127 5069 153 1003 55 179 23 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.03 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.01 ]
C [ 0.00 0.01 0.00 0.01 0.02 0.04 0.03 0.00 0.04 0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 -0.00 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.01 0.04 0.07 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.03 0.06 0.03 0.04 0.02 0.03 -0.01 0.03 0.01 0.01 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.02 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 11187

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 1582

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 610

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 152

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 137

CWM

PFM

     

HCWM