Detailed information of deep learning profile BP001368.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF677 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF677
Model ID: BP001368.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA2101.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q86XU0  
Source: ENCSR279KDC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.11 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.03 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.03 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.02 0.07 -0.00 0.06 0.07 -0.00 0.02 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 734 744 666 696 733 670 763 743 754 765 710 699 665 717 692 605 440 451 448 424 9 2 65 22 1133 265 178 689 675 430 385 210 128 302 814 452 532 686 725 586 485 471 493 470 576 622 608 691 806 711 ]
C [ 599 593 664 676 683 692 621 621 619 628 712 613 708 530 346 308 1941 215 161 189 9 2715 56 46 223 468 1309 147 152 214 382 278 1216 1603 685 646 784 750 500 538 489 535 536 648 976 660 587 553 497 595 ]
G [ 631 589 588 655 551 559 570 475 602 610 507 543 612 579 917 1528 164 125 1898 353 153 2 9 5 808 241 92 1085 1558 1276 1135 128 112 202 326 630 426 510 738 591 475 446 503 450 431 451 527 608 548 559 ]
T [ 767 805 813 704 764 810 777 892 756 728 802 876 746 905 776 290 186 1940 224 1765 2560 12 2601 2658 567 1757 1152 810 346 811 829 2115 1275 624 906 1003 989 785 768 1016 1282 1279 1199 1163 748 998 1009 879 880 866 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.02 0.01 -0.04 -0.03 -0.02 -0.03 0.03 -0.00 -0.02 0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.03 -0.02 0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.02 -0.01 -0.06 0.12 -0.02 -0.01 -0.02 0.00 0.05 -0.02 -0.02 -0.00 0.00 -0.01 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02 ]
G [ 0.01 0.01 0.02 0.04 -0.01 -0.01 0.05 0.00 0.02 -0.04 -0.02 -0.05 0.02 -0.01 -0.03 0.05 0.04 0.03 0.03 -0.02 -0.03 0.00 0.01 0.01 -0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.02 0.03 -0.02 0.03 0.07 -0.02 0.06 0.08 -0.00 0.03 0.02 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.00 -0.00 0.01 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 318

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 259

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 180

CWM

PFM

     

HCWM