Detailed information of deep learning profile BP001368.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF677 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF677
Model ID: BP001368.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA2101.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q86XU0  
Source: ENCSR279KDC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.02 -0.00 0.07 0.06 -0.00 0.07 0.02 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.03 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.03 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.11 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 866 880 879 1009 998 748 1163 1199 1279 1282 1016 768 785 989 1003 906 624 1275 2115 829 811 346 810 1152 1757 567 2658 2601 12 2560 1765 224 1940 186 290 776 905 746 876 802 728 756 892 777 810 764 704 813 805 767 ]
C [ 559 548 608 527 451 431 450 503 446 475 591 738 510 426 630 326 202 112 128 1135 1276 1558 1085 92 241 808 5 9 2 153 353 1898 125 164 1528 917 579 612 543 507 610 602 475 570 559 551 655 588 589 631 ]
G [ 595 497 553 587 660 976 648 536 535 489 538 500 750 784 646 685 1603 1216 278 382 214 152 147 1309 468 223 46 56 2715 9 189 161 215 1941 308 346 530 708 613 712 628 619 621 621 692 683 676 664 593 599 ]
T [ 711 806 691 608 622 576 470 493 471 485 586 725 686 532 452 814 302 128 210 385 430 675 689 178 265 1133 22 65 2 9 424 448 451 440 605 692 717 665 699 710 765 754 743 763 670 733 696 666 744 734 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.03 0.04 0.01 0.01 -0.01 0.00 0.02 0.03 -0.00 0.08 0.06 -0.02 0.07 0.03 -0.02 0.03 -0.02 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.03 -0.02 0.03 0.03 0.04 0.05 -0.03 -0.01 0.02 -0.05 -0.02 -0.04 0.02 0.00 0.05 -0.01 -0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 ]
G [ 0.02 0.01 0.01 0.04 0.05 -0.01 0.00 -0.00 -0.02 -0.02 0.05 0.00 -0.02 -0.01 -0.02 0.12 -0.06 -0.01 -0.02 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 0.01 -0.02 -0.03 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.02 -0.00 0.03 -0.03 -0.02 -0.03 -0.04 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 318

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 259

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 180

CWM

PFM

     

HCWM