Detailed information of deep learning profile BP001367.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF324 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF324
Model ID: BP001367.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1977.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: O75467  
Source: ENCSR712KVZ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.02 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.04 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.09 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.02 ]
G [ 0.03 0.04 -0.01 -0.00 0.00 0.07 -0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.14 -0.00 -0.00 0.05 0.13 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.05 0.06 0.00 -0.00 -0.00 0.01 ]

Frequency matrix

       
A [ 600 327 688 677 557 1307 267 252 253 2286 274 366 331 226 1408 433 277 1701 2731 84 125 34 2945 2731 147 12 1642 126 284 5 49 49 93 2390 2624 120 2289 217 1834 414 1030 895 2404 2344 2105 296 419 2167 2130 376 ]
C [ 222 264 316 222 211 814 288 187 907 172 292 1630 2016 2218 227 88 157 228 60 17 71 2865 29 36 10 7 540 71 13 3 405 43 1963 69 122 1922 358 392 511 1025 197 1517 186 177 235 339 1919 255 209 308 ]
G [ 1936 367 1477 1849 1967 462 232 227 189 281 240 213 212 202 151 2344 2391 974 152 332 2649 37 14 179 2834 2977 47 23 2691 2990 39 120 137 470 160 184 187 183 187 229 1518 292 221 249 366 207 215 247 364 286 ]
T [ 248 2048 525 258 271 423 2219 2340 1657 267 2200 797 447 360 1220 141 181 103 63 2573 161 70 18 60 15 10 777 2786 18 8 2513 2794 813 77 100 780 172 2214 474 1338 261 302 195 236 300 2164 453 337 303 2036 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 -0.02 0.04 0.04 -0.01 -0.03 -0.03 0.06 0.05 0.00 -0.04 0.04 -0.00 0.02 -0.02 -0.03 -0.02 -0.01 0.01 0.03 -0.03 -0.01 -0.00 -0.02 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 -0.00 0.01 0.02 -0.02 0.01 0.03 -0.02 -0.02 -0.01 0.10 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.04 0.06 -0.03 0.04 -0.01 0.01 0.03 0.04 0.02 0.05 0.02 0.00 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.04 0.04 -0.04 -0.00 0.03 0.08 -0.02 -0.05 -0.02 0.09 0.14 -0.06 -0.04 0.06 0.13 -0.05 0.03 0.01 0.07 -0.01 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.02 -0.03 0.04 0.03 0.01 -0.03 -0.01 -0.03 -0.01 0.02 0.06 -0.04 -0.01 0.06 0.07 0.02 -0.03 -0.02 0.04 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 476

CWM

PFM

     

HCWM