Detailed information of deep learning profile BP001367.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF324 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF324
Model ID: BP001367.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1977.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: O75467  
Source: ENCSR712KVZ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.06 0.05 0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.13 0.05 -0.00 -0.00 0.14 0.08 -0.00 -0.00 -0.00 0.07 0.00 -0.00 -0.01 0.04 0.03 ]
G [ 0.02 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.09 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.03 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.04 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.02 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2036 303 337 453 2164 300 236 195 302 261 1338 474 2214 172 780 100 77 813 2794 2513 8 18 2786 777 10 15 60 18 70 161 2573 63 103 181 141 1220 360 447 797 2200 267 1657 2340 2219 423 271 258 525 2048 248 ]
C [ 286 364 247 215 207 366 249 221 292 1518 229 187 183 187 184 160 470 137 120 39 2990 2691 23 47 2977 2834 179 14 37 2649 332 152 974 2391 2344 151 202 212 213 240 281 189 227 232 462 1967 1849 1477 367 1936 ]
G [ 308 209 255 1919 339 235 177 186 1517 197 1025 511 392 358 1922 122 69 1963 43 405 3 13 71 540 7 10 36 29 2865 71 17 60 228 157 88 227 2218 2016 1630 292 172 907 187 288 814 211 222 316 264 222 ]
T [ 376 2130 2167 419 296 2105 2344 2404 895 1030 414 1834 217 2289 120 2624 2390 93 49 49 5 284 126 1642 12 147 2731 2945 34 125 84 2731 1701 277 433 1408 226 331 366 274 2286 253 252 267 1307 557 677 688 327 600 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.02 -0.03 0.02 0.07 0.06 -0.01 -0.04 0.06 0.02 -0.01 -0.03 -0.01 -0.03 0.01 0.03 0.04 -0.03 -0.02 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.07 0.01 0.03 -0.05 0.13 0.06 -0.04 -0.06 0.14 0.09 -0.02 -0.05 -0.02 0.08 0.03 -0.00 -0.04 0.04 0.04 -0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.00 0.02 0.05 0.02 0.04 0.03 0.01 -0.01 0.04 -0.03 0.06 -0.04 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 0.10 -0.01 -0.02 -0.02 0.03 0.01 -0.02 0.02 0.01 -0.00 0.01 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.02 -0.00 -0.01 -0.03 0.03 0.01 -0.01 -0.02 -0.03 -0.02 0.02 -0.00 0.04 -0.04 0.00 0.05 0.06 -0.03 -0.03 -0.01 0.04 0.04 -0.02 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 476

CWM

PFM

     

HCWM