Detailed information of deep learning profile BP001364.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for HSF2 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: HSF2
Model ID: BP001364.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: Heat shock factors
Family: HSF factors
JASPAR ID: MA0770.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q03933  
Source: ENCSR764ZBK
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.05 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.07 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.10 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.04 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.04 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 847 836 872 871 895 851 862 863 836 769 825 812 748 908 951 781 655 357 188 84 52 2184 0 3153 2998 717 893 316 161 42 223 1213 616 862 846 824 798 836 878 785 870 866 870 895 790 798 858 831 874 807 ]
C [ 1007 1001 990 1015 978 982 1017 1005 983 1050 1012 1001 1032 974 807 1028 1143 409 277 3496 1196 120 3 239 145 1246 915 255 126 3418 1437 783 954 943 941 979 1041 978 1016 1006 962 989 958 932 983 965 952 1004 961 979 ]
G [ 929 894 925 880 862 936 899 887 909 913 828 906 959 861 905 952 838 330 260 39 137 1299 3631 88 236 847 903 167 122 72 250 880 732 1091 1012 1019 905 851 862 910 926 895 914 908 948 965 931 981 854 963 ]
T [ 851 903 847 868 899 865 856 879 906 902 969 915 895 891 971 873 998 2538 2909 15 2249 31 0 154 255 824 923 2896 3225 102 1724 758 1332 738 835 812 890 969 878 933 876 884 892 899 913 906 893 818 945 885 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 -0.05 0.03 -0.04 0.05 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.02 -0.03 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.02 0.01 0.00 -0.02 0.07 0.02 0.02 -0.03 0.00 -0.01 0.03 -0.00 -0.01 -0.02 0.06 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 ]
G [ 0.01 0.01 0.02 0.00 0.00 -0.02 0.01 0.02 0.10 -0.03 0.00 0.00 0.03 -0.01 -0.01 -0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 0.02 0.04 -0.04 0.03 -0.06 -0.04 -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.04 0.05 -0.02 0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 204

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 188

CWM

PFM

     

HCWM