Detailed information of deep learning profile BP001364.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for HSF2 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: HSF2
Model ID: BP001364.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: Heat shock factors
Family: HSF factors
JASPAR ID: MA0770.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q03933  
Source: ENCSR764ZBK
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.04 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.04 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.10 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.07 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.05 0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 885 945 818 893 906 913 899 892 884 876 933 878 969 890 812 835 738 1332 758 1724 102 3225 2896 923 824 255 154 0 31 2249 15 2909 2538 998 873 971 891 895 915 969 902 906 879 856 865 899 868 847 903 851 ]
C [ 963 854 981 931 965 948 908 914 895 926 910 862 851 905 1019 1012 1091 732 880 250 72 122 167 903 847 236 88 3631 1299 137 39 260 330 838 952 905 861 959 906 828 913 909 887 899 936 862 880 925 894 929 ]
G [ 979 961 1004 952 965 983 932 958 989 962 1006 1016 978 1041 979 941 943 954 783 1437 3418 126 255 915 1246 145 239 3 120 1196 3496 277 409 1143 1028 807 974 1032 1001 1012 1050 983 1005 1017 982 978 1015 990 1001 1007 ]
T [ 807 874 831 858 798 790 895 870 866 870 785 878 836 798 824 846 862 616 1213 223 42 161 316 893 717 2998 3153 0 2184 52 84 188 357 655 781 951 908 748 812 825 769 836 863 862 851 895 871 872 836 847 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.02 0.05 0.04 0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.04 -0.06 0.03 -0.04 0.04 0.02 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 -0.02 -0.01 -0.01 0.03 0.00 0.00 -0.03 0.10 0.02 0.01 -0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 0.01 ]
G [ 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.06 -0.02 -0.01 -0.00 0.03 -0.01 0.00 -0.03 0.02 0.02 0.07 -0.02 0.00 0.01 0.02 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.03 -0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.04 0.05 -0.04 0.03 -0.05 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 204

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 188

CWM

PFM

     

HCWM