Detailed information of deep learning profile BP001362.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF350 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF350
Model ID: BP001362.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0612.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9GZX5  
Source: ENCSR854ORP
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.02 0.02 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 211 154 123 156 144 122 164 216 154 107 80 107 123 140 187 56 82 34 20 21 3 5 34 396 21 137 389 17 15 93 322 206 64 78 77 64 150 106 224 199 87 91 93 205 97 202 76 146 111 100 ]
C [ 80 80 82 84 89 78 100 69 59 120 150 134 159 155 34 45 150 280 243 18 6 2 5 7 13 10 23 348 329 105 32 80 225 260 69 149 73 63 74 80 67 72 149 80 174 89 105 118 131 149 ]
G [ 83 132 148 94 107 167 101 73 161 142 98 120 94 64 122 255 88 20 25 8 1 9 17 24 24 260 21 34 28 35 63 105 31 35 45 70 128 190 73 80 191 66 109 65 61 69 90 79 98 80 ]
T [ 70 78 91 110 104 77 79 86 70 75 116 83 68 85 101 88 124 110 156 397 434 428 388 17 386 37 11 45 72 211 27 53 124 71 253 161 93 85 73 85 99 215 93 94 112 84 173 101 104 115 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.02 -0.02 0.00 0.02 -0.01 -0.02 -0.00 0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.02 -0.02 -0.00 -0.02 -0.01 0.02 0.02 0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.02 0.02 0.02 -0.01 0.02 -0.01 -0.02 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 534

CWM

PFM

     

HCWM