Detailed information of deep learning profile BP001362.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF350 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF350
Model ID: BP001362.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0612.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9GZX5  
Source: ENCSR854ORP
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.02 0.02 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 115 104 101 173 84 112 94 93 215 99 85 73 85 93 161 253 71 124 53 27 211 72 45 11 37 386 17 388 428 434 397 156 110 124 88 101 85 68 83 116 75 70 86 79 77 104 110 91 78 70 ]
C [ 80 98 79 90 69 61 65 109 66 191 80 73 190 128 70 45 35 31 105 63 35 28 34 21 260 24 24 17 9 1 8 25 20 88 255 122 64 94 120 98 142 161 73 101 167 107 94 148 132 83 ]
G [ 149 131 118 105 89 174 80 149 72 67 80 74 63 73 149 69 260 225 80 32 105 329 348 23 10 13 7 5 2 6 18 243 280 150 45 34 155 159 134 150 120 59 69 100 78 89 84 82 80 80 ]
T [ 100 111 146 76 202 97 205 93 91 87 199 224 106 150 64 77 78 64 206 322 93 15 17 389 137 21 396 34 5 3 21 20 34 82 56 187 140 123 107 80 107 154 216 164 122 144 156 123 154 211 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.02 -0.01 0.02 -0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.01 0.00 0.02 0.02 -0.01 -0.02 -0.00 -0.02 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.02 -0.01 0.02 0.00 -0.02 0.02 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 534

CWM

PFM

     

HCWM