Detailed information of deep learning profile BP001361.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF629 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF629
Model ID: BP001361.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0645.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UEG4  
Source: ENCSR363ASY
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.02 0.08 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.01 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.02 0.04 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.08 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.12 0.13 0.08 -0.01 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.01 0.03 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.02 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 2121 1754 1668 1477 1819 3597 6798 3014 1444 852 661 944 10810 2831 750 957 833 1251 915 1321 1200 12043 569 476 883 2431 1073 11233 13376 15674 14781 84 45 22 1434 4330 8550 2018 10087 7903 3563 7868 7003 3519 6537 3606 3184 5006 3941 2779 ]
C [ 3824 8277 4093 9061 3200 2107 1274 1535 11020 12508 1976 11804 1607 1336 1974 1756 945 8150 11316 4022 11317 1229 1847 14993 1185 664 1649 608 1104 101 148 202 5 5 192 3297 2540 3781 1301 2196 2589 2171 2680 3725 3146 4547 5193 3820 5403 6476 ]
G [ 1802 1657 1662 1715 1889 8195 4288 10362 1461 959 670 669 2147 10719 1151 1776 1194 1350 809 823 820 1725 821 328 340 12505 1456 3650 1160 355 1080 214 16207 16229 14443 5400 2304 2146 3531 2482 2392 3891 3277 2609 3502 4254 2429 2820 2842 2229 ]
T [ 8517 4576 8841 4011 9356 2365 3904 1353 2339 1945 12957 2847 1700 1378 12389 11775 13292 5513 3224 10098 2927 1267 13027 467 13856 664 12086 773 624 134 255 15764 7 8 195 3237 2870 8319 1345 3683 7720 2334 3304 6411 3079 3857 5458 4618 4078 4780 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 -0.02 -0.02 0.03 0.01 -0.02 -0.01 -0.00 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 0.00 0.03 0.02 0.08 0.07 -0.04 -0.02 -0.06 -0.01 -0.02 0.00 -0.01 0.02 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.00 0.03 0.05 0.00 0.06 0.00 0.02 0.03 0.03 -0.01 -0.01 0.03 0.05 0.02 -0.00 0.02 0.09 0.04 0.01 0.02 0.00 0.02 -0.03 -0.03 0.01 -0.03 -0.03 -0.02 0.04 0.03 0.03 -0.00 0.01 ]
G [ 0.01 0.02 0.02 0.00 0.00 -0.01 -0.03 0.02 0.03 -0.01 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.04 0.01 -0.00 0.02 0.06 0.03 0.04 0.02 -0.00 0.01 -0.01 0.12 0.13 0.09 -0.02 0.01 0.01 0.02 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 0.04 0.02 -0.01 -0.01 0.05 0.02 0.03 0.02 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.05 -0.02 0.02 -0.01 0.03 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.08 -0.05 -0.04 -0.04 0.03 -0.01 -0.00 -0.02 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 3226

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 3143

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 279

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 174

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 155

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 114

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_9

Num. of seqlets: 39

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_10

Num. of seqlets: 32