Detailed information of deep learning profile BP001361.1

  1. Home
  2. Deep Learning Profile > BP001361.1
This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF629 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF629
Model ID: BP001361.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0645.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UEG4  
Source: ENCSR363ASY
Model: BPNet
Download trained model
Download TF-MoDISco Report

Sequence logo

 

Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.08 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.02 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.03 0.01 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.08 0.13 0.12 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.08 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.04 0.02 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.08 0.02 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 4780 4078 4618 5458 3857 3079 6411 3304 2334 7720 3683 1345 8319 2870 3237 195 8 7 15764 255 134 624 773 12086 664 13856 467 13027 1267 2927 10098 3224 5513 13292 11775 12389 1378 1700 2847 12957 1945 2339 1353 3904 2365 9356 4011 8841 4576 8517 ]
C [ 2229 2842 2820 2429 4254 3502 2609 3277 3891 2392 2482 3531 2146 2304 5400 14443 16229 16207 214 1080 355 1160 3650 1456 12505 340 328 821 1725 820 823 809 1350 1194 1776 1151 10719 2147 669 670 959 1461 10362 4288 8195 1889 1715 1662 1657 1802 ]
G [ 6476 5403 3820 5193 4547 3146 3725 2680 2171 2589 2196 1301 3781 2540 3297 192 5 5 202 148 101 1104 608 1649 664 1185 14993 1847 1229 11317 4022 11316 8150 945 1756 1974 1336 1607 11804 1976 12508 11020 1535 1274 2107 3200 9061 4093 8277 3824 ]
T [ 2779 3941 5006 3184 3606 6537 3519 7003 7868 3563 7903 10087 2018 8550 4330 1434 22 45 84 14781 15674 13376 11233 1073 2431 883 476 569 12043 1200 1321 915 1251 833 957 750 2831 10810 944 661 852 1444 3014 6798 3597 1819 1477 1668 1754 2121 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 -0.02 -0.00 -0.01 0.03 -0.04 -0.04 -0.05 0.08 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.01 0.02 -0.02 0.05 -0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.05 -0.01 -0.01 0.02 0.04 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 ]
C [ -0.00 0.02 0.01 0.01 -0.02 0.09 0.13 0.12 -0.01 0.01 -0.00 0.02 0.04 0.03 0.06 0.02 -0.00 0.01 0.04 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02 -0.01 0.03 0.02 -0.03 -0.01 0.00 0.00 0.02 0.02 0.01 ]
G [ 0.01 -0.00 0.03 0.03 0.04 -0.02 -0.03 -0.03 0.01 -0.03 -0.03 0.02 0.00 0.02 0.01 0.04 0.09 0.02 -0.00 0.02 0.05 0.03 -0.01 -0.01 0.03 0.03 0.02 0.00 0.06 0.00 0.05 0.03 0.00 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 0.02 -0.01 0.00 -0.02 -0.01 -0.06 -0.02 -0.04 0.07 0.08 0.02 0.03 0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.02 0.01 0.03 -0.02 -0.02 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 3226

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 3143

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 279

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 174

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 155

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 114

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_9

Num. of seqlets: 39

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_10

Num. of seqlets: 32

CWM

PFM

     

HCWM