Detailed information of deep learning profile BP001360.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF680 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF680
Model ID: BP001360.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1729.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8NEM1  
Source: ENCSR307CKC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.03 -0.00 0.12 0.06 0.00 0.11 0.01 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 ]
C [ 0.02 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.12 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 1759 1869 2396 2726 1831 1707 1693 1534 1590 1524 1343 1391 1726 1392 1881 3342 1728 1601 2083 773 2107 5289 4635 18 7115 6652 1239 7084 3626 399 2078 4549 2021 1751 2058 2571 2306 2315 2006 2134 1974 2887 2167 2829 2789 2446 2202 1904 2299 2766 ]
C [ 2601 1817 1112 1088 1034 1199 1298 2444 1046 993 1044 1185 3250 2778 2460 925 1453 257 1194 5110 3854 117 33 2 15 39 42 36 1726 992 831 530 274 828 1419 1384 1693 1405 1685 1558 1018 1117 2107 1649 1543 1499 1172 1233 1060 1013 ]
G [ 1377 1489 2320 1922 2796 1518 1327 1478 1565 1323 3303 1420 1004 1401 1236 1900 1492 4830 1949 272 309 1415 1966 7129 7 324 5741 17 360 287 1979 468 4187 3544 1242 1411 1461 1947 1818 1833 2537 1767 1408 1356 1466 1574 1463 2116 2392 1981 ]
T [ 1412 1974 1321 1413 1488 2725 2831 1693 2948 3309 1459 3153 1169 1578 1572 982 2476 461 1923 994 879 328 515 0 12 134 127 12 1437 5471 2261 1602 667 1026 2430 1783 1689 1482 1640 1624 1620 1378 1467 1315 1351 1630 2312 1896 1398 1389 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.05 -0.01 0.12 0.06 0.03 0.11 0.03 -0.02 0.02 0.03 0.02 0.00 0.01 0.01 0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04 0.01 0.03 -0.00 0.02 0.04 0.04 -0.04 -0.02 -0.03 -0.04 -0.01 -0.04 -0.02 0.04 0.03 -0.01 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.00 0.02 0.02 0.06 0.02 -0.01 0.00 0.03 0.02 0.12 -0.04 -0.01 0.07 -0.04 -0.02 -0.01 0.01 -0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
T [ 0.02 0.00 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 -0.00 0.02 0.02 0.01 0.01 0.00 -0.03 -0.03 -0.01 -0.01 -0.04 0.01 0.04 0.02 0.01 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]