Detailed information of deep learning profile BP001360.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF680 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF680
Model ID: BP001360.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1729.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8NEM1  
Source: ENCSR307CKC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.01 0.03 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.12 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.02 ]
T [ -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.01 0.11 0.00 0.06 0.12 -0.00 0.03 0.04 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 1389 1398 1896 2312 1630 1351 1315 1467 1378 1620 1624 1640 1482 1689 1783 2430 1026 667 1602 2261 5471 1437 12 127 134 12 0 515 328 879 994 1923 461 2476 982 1572 1578 1169 3153 1459 3309 2948 1693 2831 2725 1488 1413 1321 1974 1412 ]
C [ 1981 2392 2116 1463 1574 1466 1356 1408 1767 2537 1833 1818 1947 1461 1411 1242 3544 4187 468 1979 287 360 17 5741 324 7 7129 1966 1415 309 272 1949 4830 1492 1900 1236 1401 1004 1420 3303 1323 1565 1478 1327 1518 2796 1922 2320 1489 1377 ]
G [ 1013 1060 1233 1172 1499 1543 1649 2107 1117 1018 1558 1685 1405 1693 1384 1419 828 274 530 831 992 1726 36 42 39 15 2 33 117 3854 5110 1194 257 1453 925 2460 2778 3250 1185 1044 993 1046 2444 1298 1199 1034 1088 1112 1817 2601 ]
T [ 2766 2299 1904 2202 2446 2789 2829 2167 2887 1974 2134 2006 2315 2306 2571 2058 1751 2021 4549 2078 399 3626 7084 1239 6652 7115 18 4635 5289 2107 773 2083 1601 1728 3342 1881 1392 1726 1391 1343 1524 1590 1534 1693 1707 1831 2726 2396 1869 1759 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 -0.04 -0.01 -0.01 -0.03 -0.03 0.00 0.01 0.01 0.02 0.02 -0.00 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.00 0.02 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 -0.01 0.01 -0.01 -0.02 -0.04 0.07 -0.01 -0.04 0.12 0.02 0.03 0.00 -0.01 0.02 0.06 0.02 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 0.03 0.00 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.03 0.04 -0.02 -0.04 -0.01 -0.04 -0.03 -0.02 -0.04 0.04 0.04 0.02 -0.00 0.03 0.01 0.04 0.03 0.04 0.01 0.01 0.00 ]
T [ 0.00 0.01 0.01 0.00 0.02 0.03 0.02 -0.02 0.03 0.11 0.03 0.06 0.12 -0.01 0.05 0.05 0.03 0.02 0.01 0.01 0.00 0.02 0.00 -0.02 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 ]