Detailed information of deep learning profile BP001359.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for TEF in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: TEF
Model ID: BP001359.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: Basic leucine zipper factors (bZIP)
Family: CEBP-related
JASPAR ID: MA0843.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q10587  
Source: ENCSR583KLD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.07 0.08 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.06 -0.00 0.02 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 864 765 765 753 736 775 827 778 768 832 780 762 738 840 779 790 777 759 769 835 821 828 727 693 779 0 2 2339 31 410 92 2902 2919 132 899 811 696 707 744 719 746 783 782 772 805 721 751 765 810 770 ]
C [ 652 701 682 677 683 743 706 656 730 663 668 652 675 673 692 716 640 707 735 706 689 640 740 421 550 5 3 11 305 30 1234 22 2 1423 863 652 694 751 702 698 690 695 660 643 623 711 709 705 669 664 ]
G [ 645 662 673 679 713 632 636 674 650 658 695 689 686 669 668 638 681 642 659 684 708 761 680 915 1426 3 140 537 76 2482 7 4 6 526 467 722 720 631 736 750 676 648 656 719 704 678 675 717 669 675 ]
T [ 768 801 809 820 797 779 760 821 781 776 786 826 830 747 790 785 831 821 766 704 711 700 782 900 174 2921 2784 42 2517 7 1596 1 2 848 700 744 819 840 747 762 817 803 831 795 797 819 794 742 781 820 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.06 -0.03 0.05 -0.04 0.03 -0.02 0.07 0.08 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.05 -0.04 0.06 -0.02 0.03 0.00 -0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 -0.04 0.01 0.02 -0.02 0.05 -0.04 -0.05 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 0.08 0.06 -0.02 0.03 -0.04 0.04 -0.03 -0.05 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 359

CWM

PFM

     

HCWM