Detailed information of deep learning profile BP001359.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for TEF in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: TEF
Model ID: BP001359.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: Basic leucine zipper factors (bZIP)
Family: CEBP-related
JASPAR ID: MA0843.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q10587  
Source: ENCSR583KLD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.02 -0.00 0.06 0.08 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.07 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 820 781 742 794 819 797 795 831 803 817 762 747 840 819 744 700 848 2 1 1596 7 2517 42 2784 2921 174 900 782 700 711 704 766 821 831 785 790 747 830 826 786 776 781 821 760 779 797 820 809 801 768 ]
C [ 675 669 717 675 678 704 719 656 648 676 750 736 631 720 722 467 526 6 4 7 2482 76 537 140 3 1426 915 680 761 708 684 659 642 681 638 668 669 686 689 695 658 650 674 636 632 713 679 673 662 645 ]
G [ 664 669 705 709 711 623 643 660 695 690 698 702 751 694 652 863 1423 2 22 1234 30 305 11 3 5 550 421 740 640 689 706 735 707 640 716 692 673 675 652 668 663 730 656 706 743 683 677 682 701 652 ]
T [ 770 810 765 751 721 805 772 782 783 746 719 744 707 696 811 899 132 2919 2902 92 410 31 2339 2 0 779 693 727 828 821 835 769 759 777 790 779 840 738 762 780 832 768 778 827 775 736 753 765 765 864 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.05 -0.03 0.04 -0.04 0.03 -0.02 0.06 0.08 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.05 -0.04 0.05 -0.02 0.02 0.01 -0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 -0.04 0.00 0.03 -0.02 0.06 -0.04 -0.05 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 0.08 0.07 -0.02 0.03 -0.04 0.05 -0.03 -0.06 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 359

CWM

PFM

     

HCWM