Detailed information of deep learning profile BP001357.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF79 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF79
Model ID: BP001357.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0661.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15937  
Source: ENCSR995FUM
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.01 0.03 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 178 121 167 180 178 211 202 252 110 62 120 148 277 113 224 165 18 9 443 20 372 85 496 18 25 205 323 23 30 20 62 118 87 98 155 148 109 156 221 194 225 173 161 205 157 156 196 183 184 176 ]
C [ 144 190 182 141 142 123 138 80 133 64 169 210 120 283 147 282 10 11 121 123 40 140 52 73 39 257 82 198 31 136 352 81 94 88 79 94 299 87 99 125 108 139 185 143 156 159 124 128 143 143 ]
G [ 155 130 120 111 171 127 151 104 101 44 69 67 182 77 114 162 21 25 19 456 79 236 52 132 47 82 30 70 20 28 128 40 38 87 297 236 95 91 160 124 154 129 111 94 124 124 158 146 113 131 ]
T [ 181 217 189 226 167 197 167 222 314 488 300 233 79 185 173 49 609 613 75 59 167 197 58 435 547 114 223 367 577 474 116 419 439 385 127 180 155 324 178 215 171 217 201 216 221 219 180 201 218 208 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.02 0.02 -0.01 0.02 -0.03 -0.01 0.01 0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.02 -0.02 -0.02 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.01 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.02 0.03 -0.00 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.02 -0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.02 0.03 0.03 -0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 0.02 0.03 -0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 -0.01 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 1583

CWM

PFM

     

HCWM