Detailed information of deep learning profile BP001356.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF331 in GM23338 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF331
Model ID: BP001356.1
Cell line/tissue: GM23338
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1726.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9NQX6  
Source: ENCSR918LRB
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 0.03 0.00 0.02 0.03 0.02 -0.00 -0.00 0.09 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.08 0.03 0.03 0.00 -0.00 0.01 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.02 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.05 -0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 473 696 523 566 592 543 407 817 572 455 923 453 905 1139 664 1320 1156 237 274 703 314 299 186 917 139 30 562 161 1790 240 51 295 161 915 363 192 217 515 822 666 717 316 456 432 476 464 571 793 406 347 ]
C [ 620 421 543 436 435 552 619 401 400 859 341 358 291 226 239 196 318 1158 1138 407 1087 1263 1251 121 43 1878 146 63 38 32 1834 1363 1445 280 127 986 1351 787 391 501 543 611 490 613 707 500 397 435 719 762 ]
G [ 465 527 482 624 492 577 616 434 749 427 476 893 481 377 905 325 349 310 287 518 290 153 135 203 1746 15 95 1660 61 1628 46 60 125 113 1118 260 139 194 365 443 359 299 341 547 410 459 653 404 350 370 ]
T [ 409 323 419 341 448 295 325 315 246 226 227 263 290 225 159 126 144 262 268 339 276 252 395 726 39 44 1164 83 78 67 36 249 236 659 359 529 260 471 389 357 348 741 680 375 374 544 346 335 492 488 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.01 0.02 0.02 0.04 0.03 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.02 -0.03 0.01 -0.01 0.06 0.02 -0.02 0.01 -0.02 0.00 0.01 -0.02 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 0.04 0.04 0.00 0.02 0.03 0.03 -0.01 -0.05 0.09 0.01 -0.04 -0.03 -0.06 0.08 0.04 0.04 0.01 -0.03 0.02 0.03 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.04 0.00 -0.02 -0.01 0.01 0.07 -0.06 -0.02 0.06 -0.02 0.06 -0.03 -0.02 -0.01 -0.03 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 0.01 ]
T [ -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.02 -0.02 -0.03 -0.01 -0.03 -0.02 -0.01 0.00 0.01 0.02 -0.04 0.01 0.01 0.00 -0.03 -0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]