Detailed information of deep learning profile BP001356.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF331 in GM23338 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF331
Model ID: BP001356.1
Cell line/tissue: GM23338
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1726.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9NQX6  
Source: ENCSR918LRB
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 -0.00 0.05 0.00 0.00 0.07 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.01 -0.00 0.00 0.03 0.03 0.08 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.09 -0.00 -0.00 0.02 0.03 0.02 0.00 0.03 0.03 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 488 492 335 346 544 374 375 680 741 348 357 389 471 260 529 359 659 236 249 36 67 78 83 1164 44 39 726 395 252 276 339 268 262 144 126 159 225 290 263 227 226 246 315 325 295 448 341 419 323 409 ]
C [ 370 350 404 653 459 410 547 341 299 359 443 365 194 139 260 1118 113 125 60 46 1628 61 1660 95 15 1746 203 135 153 290 518 287 310 349 325 905 377 481 893 476 427 749 434 616 577 492 624 482 527 465 ]
G [ 762 719 435 397 500 707 613 490 611 543 501 391 787 1351 986 127 280 1445 1363 1834 32 38 63 146 1878 43 121 1251 1263 1087 407 1138 1158 318 196 239 226 291 358 341 859 400 401 619 552 435 436 543 421 620 ]
T [ 347 406 793 571 464 476 432 456 316 717 666 822 515 217 192 363 915 161 295 51 240 1790 161 562 30 139 917 186 299 314 703 274 237 1156 1320 664 1139 905 453 923 455 572 817 407 543 592 566 523 696 473 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.02 0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.03 0.00 0.01 0.01 -0.04 0.02 0.01 0.00 -0.01 -0.02 -0.03 -0.01 -0.03 -0.02 -0.02 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 ]
C [ 0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.03 -0.01 -0.02 -0.03 0.06 -0.02 0.06 -0.02 -0.06 0.07 0.01 -0.01 -0.02 0.00 0.04 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.03 0.02 -0.03 0.01 0.04 0.04 0.08 -0.06 -0.03 -0.04 0.01 0.09 -0.05 -0.01 0.03 0.03 0.02 0.00 0.04 0.04 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.02 0.01 0.00 -0.02 0.01 -0.02 0.02 0.06 -0.01 0.01 -0.03 0.02 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.00 -0.00 ]