Detailed information of deep learning profile BP001353.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF112 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF112
Model ID: BP001353.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0594.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UJU3  
Source: ENCSR751PNN
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.05 0.03 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.02 0.05 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.02 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.04 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.01 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 44 83 320 58 44 25 88 43 372 60 36 218 34 31 12 29 9 1 385 457 2 16 41 3 26 191 12 42 3 0 10 4 497 509 483 1 414 9 23 19 31 37 381 40 44 298 44 99 70 38 ]
C [ 93 49 41 64 56 39 26 76 29 22 250 44 66 88 17 4 477 467 58 20 3 8 99 477 230 46 20 4 0 2 0 3 10 0 5 65 22 351 36 389 391 377 47 330 293 43 74 35 45 340 ]
G [ 41 301 112 42 57 52 337 48 63 391 29 206 35 19 35 459 7 3 44 14 5 49 38 3 10 243 16 454 503 4 500 0 1 0 12 11 47 14 14 30 9 21 46 48 42 108 58 335 359 40 ]
T [ 332 77 37 346 353 394 59 343 46 37 195 42 375 372 446 18 17 39 23 19 500 437 332 27 244 30 462 10 4 504 0 503 2 1 10 433 27 136 437 72 79 75 36 92 131 61 334 41 36 92 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.02 0.01 0.02 -0.03 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 0.00 -0.01 -0.02 -0.00 -0.03 0.04 0.05 0.03 -0.03 0.01 -0.01 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 -0.00 -0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.03 -0.01 0.00 -0.01 -0.03 0.03 -0.01 0.01 0.00 0.01 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.01 -0.00 -0.02 -0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 0.02 0.05 -0.02 0.06 -0.02 -0.04 -0.01 0.00 -0.02 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.05 0.02 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.03 -0.02 -0.02 0.04 -0.01 0.06 -0.01 -0.03 -0.01 0.03 -0.00 0.01 0.01 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 350