Detailed information of deep learning profile BP001353.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF112 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF112
Model ID: BP001353.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0594.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UJU3  
Source: ENCSR751PNN
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.05 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.05 0.02 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.03 0.05 0.04 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 92 36 41 334 61 131 92 36 75 79 72 437 136 27 433 10 1 2 503 0 504 4 10 462 30 244 27 332 437 500 19 23 39 17 18 446 372 375 42 195 37 46 343 59 394 353 346 37 77 332 ]
C [ 40 359 335 58 108 42 48 46 21 9 30 14 14 47 11 12 0 1 0 500 4 503 454 16 243 10 3 38 49 5 14 44 3 7 459 35 19 35 206 29 391 63 48 337 52 57 42 112 301 41 ]
G [ 340 45 35 74 43 293 330 47 377 391 389 36 351 22 65 5 0 10 3 0 2 0 4 20 46 230 477 99 8 3 20 58 467 477 4 17 88 66 44 250 22 29 76 26 39 56 64 41 49 93 ]
T [ 38 70 99 44 298 44 40 381 37 31 19 23 9 414 1 483 509 497 4 10 0 3 42 12 191 26 3 41 16 2 457 385 1 9 29 12 31 34 218 36 60 372 43 88 25 44 58 320 83 44 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.03 -0.01 -0.03 -0.01 0.06 -0.01 0.04 -0.02 -0.02 0.03 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.05 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.02 0.00 -0.01 -0.04 -0.02 0.06 -0.02 0.05 0.02 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.02 -0.00 -0.01 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 -0.01 0.03 -0.03 -0.01 0.00 -0.01 -0.03 0.01 -0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 -0.02 -0.00 0.01 0.01 0.04 0.03 -0.02 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.03 0.03 0.05 0.04 -0.03 -0.00 -0.02 -0.01 0.00 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 -0.03 0.02 0.01 -0.02 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 350