Detailed information of deep learning profile BP001352.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF530 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF530
Model ID: BP001352.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1981.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P9A1  
Source: ENCSR701RXW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.04 0.00 0.00 -0.00 0.04 0.05 0.03 0.01 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 ]

Frequency matrix

       
A [ 180 199 197 200 192 206 221 217 223 263 227 184 175 214 287 244 147 32 412 715 411 30 13 368 298 651 9 42 36 43 195 302 112 281 384 233 150 185 199 296 203 195 207 181 182 261 230 203 243 275 ]
C [ 171 171 160 159 186 169 166 160 162 140 136 153 154 161 128 145 38 23 175 20 37 9 10 188 88 20 9 2 10 267 455 103 85 171 105 174 105 147 228 131 170 164 169 179 152 154 162 226 160 142 ]
G [ 256 228 236 238 250 234 229 245 237 236 264 301 235 222 239 161 489 699 120 13 176 703 723 75 257 60 731 711 701 394 22 215 457 199 157 199 206 273 194 195 232 254 254 204 275 204 233 195 204 201 ]
T [ 153 162 167 163 132 151 144 138 138 121 133 122 196 163 106 210 86 6 53 12 136 18 14 129 117 29 11 5 13 56 88 140 106 109 114 154 299 155 139 138 155 147 130 196 151 141 135 136 153 142 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.03 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.00 -0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.02 0.03 -0.00 -0.01 -0.00 0.04 0.05 -0.00 0.00 -0.00 0.04 0.05 0.04 0.02 -0.01 0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 ]