Detailed information of deep learning profile BP001352.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF530 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF530
Model ID: BP001352.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1981.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P9A1  
Source: ENCSR701RXW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.01 0.03 0.05 0.04 -0.00 0.00 0.00 0.04 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 142 153 136 135 141 151 196 130 147 155 138 139 155 299 154 114 109 106 140 88 56 13 5 11 29 117 129 14 18 136 12 53 6 86 210 106 163 196 122 133 121 138 138 144 151 132 163 167 162 153 ]
C [ 201 204 195 233 204 275 204 254 254 232 195 194 273 206 199 157 199 457 215 22 394 701 711 731 60 257 75 723 703 176 13 120 699 489 161 239 222 235 301 264 236 237 245 229 234 250 238 236 228 256 ]
G [ 142 160 226 162 154 152 179 169 164 170 131 228 147 105 174 105 171 85 103 455 267 10 2 9 20 88 188 10 9 37 20 175 23 38 145 128 161 154 153 136 140 162 160 166 169 186 159 160 171 171 ]
T [ 275 243 203 230 261 182 181 207 195 203 296 199 185 150 233 384 281 112 302 195 43 36 42 9 651 298 368 13 30 411 715 412 32 147 244 287 214 175 184 227 263 223 217 221 206 192 200 197 199 180 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.01 -0.01 0.02 0.04 0.05 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.05 0.04 -0.00 -0.01 -0.00 0.03 0.02 -0.00 0.01 0.00 0.01 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.01 0.02 0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.03 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.01 0.00 -0.00 ]