Detailed information of deep learning profile BP001348.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF75A in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF75A
Model ID: BP001348.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA2097.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q96N20  
Source: ENCSR099MNR
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.05 0.03 0.05 -0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.04 0.02 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 1293 591 683 468 666 624 459 998 639 511 544 773 495 749 856 516 548 660 1385 1438 348 436 334 10 55 11 9 135 4 2436 7 1806 347 447 382 778 380 366 1093 379 1277 481 438 453 1058 514 1248 706 418 436 ]
C [ 492 441 493 611 594 505 521 490 619 735 509 739 701 527 528 984 459 453 494 400 207 872 804 101 378 34 2470 2335 2553 20 2537 258 680 487 1105 694 697 618 395 1339 417 676 542 906 472 428 410 461 447 404 ]
G [ 348 1044 822 618 583 529 1010 440 780 530 537 501 497 720 626 528 440 1066 315 364 1555 1074 132 5 99 7 8 11 6 44 6 146 479 301 547 466 448 471 660 378 371 368 405 409 585 371 451 826 1199 1217 ]
T [ 437 494 572 873 727 912 580 642 532 794 980 557 877 574 560 542 1123 391 376 368 460 188 1300 2454 2038 2518 83 89 7 70 20 360 1064 1335 536 632 1045 1115 422 474 505 1045 1185 802 455 1257 461 577 506 513 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.02 -0.01 -0.02 -0.02 -0.00 -0.03 0.04 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.02 0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.05 0.03 0.05 -0.02 0.05 -0.01 0.01 0.01 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.00 -0.02 -0.01 -0.03 -0.02 0.00 0.00 0.00 -0.02 0.01 0.00 0.00 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.04 0.02 0.05 -0.00 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 422