Detailed information of deep learning profile BP001341.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZKSCAN5 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZKSCAN5
Model ID: BP001341.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: MA1652.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9Y2L8  
Source: ENCSR159BTO
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 -0.00 0.02 0.03 0.00 0.04 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 643 625 655 666 650 681 638 651 695 640 592 663 617 589 674 596 557 638 488 548 892 455 478 616 21 2 2427 653 0 18 0 72 829 512 617 641 638 546 719 682 607 656 634 593 711 579 645 702 594 584 ]
C [ 1047 1028 1051 1039 1079 977 1020 1053 1003 1047 1090 1045 1031 1141 1096 1092 1158 1039 1260 1222 802 1211 1026 1678 7 3002 123 2378 2661 0 3123 2731 672 1188 1087 1020 1026 1108 943 1037 1127 998 1092 1156 992 1018 1089 955 1009 1125 ]
G [ 691 718 698 670 681 698 713 737 676 667 664 642 644 684 632 677 645 592 652 555 642 431 429 374 7 3 230 11 1 17 1 9 372 780 549 669 657 678 700 674 711 727 665 687 629 717 718 678 699 682 ]
T [ 747 757 724 753 718 772 757 687 754 774 782 778 836 714 726 763 768 859 728 803 792 1031 1195 460 3093 121 348 86 466 3093 4 316 1255 648 875 798 807 796 766 735 683 747 737 692 796 814 676 793 826 737 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.02 0.02 0.01 -0.03 -0.01 -0.01 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.02 0.03 -0.01 0.02 0.03 -0.03 0.04 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.02 0.01 -0.03 -0.02 0.00 -0.02 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.03 -0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 133