Detailed information of deep learning profile BP001341.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZKSCAN5 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZKSCAN5
Model ID: BP001341.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: MA1652.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9Y2L8  
Source: ENCSR159BTO
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.04 0.00 0.03 0.02 -0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 737 826 793 676 814 796 692 737 747 683 735 766 796 807 798 875 648 1255 316 4 3093 466 86 348 121 3093 460 1195 1031 792 803 728 859 768 763 726 714 836 778 782 774 754 687 757 772 718 753 724 757 747 ]
C [ 682 699 678 718 717 629 687 665 727 711 674 700 678 657 669 549 780 372 9 1 17 1 11 230 3 7 374 429 431 642 555 652 592 645 677 632 684 644 642 664 667 676 737 713 698 681 670 698 718 691 ]
G [ 1125 1009 955 1089 1018 992 1156 1092 998 1127 1037 943 1108 1026 1020 1087 1188 672 2731 3123 0 2661 2378 123 3002 7 1678 1026 1211 802 1222 1260 1039 1158 1092 1096 1141 1031 1045 1090 1047 1003 1053 1020 977 1079 1039 1051 1028 1047 ]
T [ 584 594 702 645 579 711 593 634 656 607 682 719 546 638 641 617 512 829 72 0 18 0 653 2427 2 21 616 478 455 892 548 488 638 557 596 674 589 617 663 592 640 695 651 638 681 650 666 655 625 643 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.02 0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.02 0.00 -0.02 -0.03 0.01 -0.02 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.03 0.04 -0.03 0.03 0.02 -0.01 0.03 -0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 -0.01 -0.01 -0.03 0.01 0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 133