Detailed information of deep learning profile BP001340.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF223 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF223
Model ID: BP001340.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0603.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UK11  
Source: ENCSR906PCS
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.04 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.03 0.03 0.00 0.02 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 657 795 734 755 674 675 769 771 618 558 644 733 603 722 637 556 676 645 505 491 452 159 30 164 32 132 1844 7 19 1677 134 231 698 293 483 797 545 563 654 802 602 607 672 718 689 783 628 631 827 636 ]
C [ 1428 1313 1335 1384 1346 1228 1260 1275 1504 1432 1439 1265 1364 1268 1366 1538 1502 1541 1550 366 335 3545 3821 457 7 2277 69 3118 3531 1258 2908 3004 1168 1320 1206 1295 1700 1436 1453 1211 1395 1217 1498 1400 1215 1224 1244 1296 1219 1438 ]
G [ 1019 1002 1064 1020 1156 1038 1149 1115 1044 967 1050 1117 1013 1012 1029 992 1029 855 977 939 2663 64 10 522 3815 1031 1524 22 59 239 250 286 473 451 1264 1067 852 900 1007 1122 998 1000 993 986 1109 1030 985 988 982 1032 ]
T [ 762 756 733 707 690 925 688 705 700 909 733 751 886 864 834 780 659 825 834 2070 416 98 5 2723 12 426 429 719 257 692 574 345 1527 1802 913 707 769 967 752 731 871 1042 703 762 853 829 1009 951 838 760 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 0.02 -0.03 -0.02 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.03 0.04 0.01 -0.02 0.02 -0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 0.02 -0.02 -0.01 0.01 0.04 0.00 0.02 -0.03 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.02 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]