Detailed information of deep learning profile BP001336.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF544 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF544
Model ID: BP001336.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0629.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6NX49  
Source: ENCSR167XFW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.07 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.08 0.06 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.08 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.05 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 153 168 173 159 151 160 179 169 143 178 164 159 152 182 178 148 215 48 7 3 1 0 11 422 83 164 112 134 2 0 6 627 270 151 235 164 117 157 158 146 148 152 177 160 143 153 138 158 143 158 ]
C [ 166 127 133 153 152 174 162 164 138 158 155 158 145 136 98 132 102 308 172 1 1 0 620 59 318 160 123 9 1 633 627 4 12 163 110 159 207 172 150 154 155 164 171 154 146 157 180 153 182 146 ]
G [ 158 169 170 164 156 154 137 160 160 146 166 153 172 152 217 145 120 142 3 34 627 633 0 11 139 143 286 86 630 0 0 0 336 249 81 152 102 132 156 172 159 151 143 156 156 174 145 145 141 130 ]
T [ 156 169 157 157 174 145 155 140 192 151 148 163 164 163 140 208 196 135 451 595 4 0 2 141 93 166 112 404 0 0 0 2 15 70 207 158 207 172 169 161 171 166 142 163 188 149 170 177 167 199 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.02 -0.01 0.05 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
C [ 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.00 -0.03 0.07 -0.01 0.02 0.01 0.01 -0.00 -0.03 0.08 0.06 -0.02 -0.03 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.03 -0.02 0.06 0.08 -0.03 -0.00 0.01 0.01 0.02 -0.01 0.07 -0.03 -0.00 -0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.03 0.05 -0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]