Detailed information of deep learning profile BP001336.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF544 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF544
Model ID: BP001336.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0629.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6NX49  
Source: ENCSR167XFW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.05 0.02 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.07 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.08 0.06 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.08 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.07 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.05 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 199 167 177 170 149 188 163 142 166 171 161 169 172 207 158 207 70 15 2 0 0 0 404 112 166 93 141 2 0 4 595 451 135 196 208 140 163 164 163 148 151 192 140 155 145 174 157 157 169 156 ]
C [ 130 141 145 145 174 156 156 143 151 159 172 156 132 102 152 81 249 336 0 0 0 630 86 286 143 139 11 0 633 627 34 3 142 120 145 217 152 172 153 166 146 160 160 137 154 156 164 170 169 158 ]
G [ 146 182 153 180 157 146 154 171 164 155 154 150 172 207 159 110 163 12 4 627 633 1 9 123 160 318 59 620 0 1 1 172 308 102 132 98 136 145 158 155 158 138 164 162 174 152 153 133 127 166 ]
T [ 158 143 158 138 153 143 160 177 152 148 146 158 157 117 164 235 151 270 627 6 0 2 134 112 164 83 422 11 0 1 3 7 48 215 148 178 182 152 159 164 178 143 169 179 160 151 159 173 168 153 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.02 -0.02 0.05 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
C [ 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.00 -0.03 0.07 -0.01 0.02 0.01 0.01 -0.00 -0.03 0.08 0.06 -0.02 -0.03 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.03 -0.02 0.06 0.08 -0.03 -0.00 0.01 0.01 0.02 -0.01 0.07 -0.03 -0.00 -0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.03 0.05 -0.01 -0.02 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 -0.00 0.01 -0.00 0.00 ]