Detailed information of deep learning profile BP001331.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF585B in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF585B
Model ID: BP001331.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0207.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q52M93  
Source: ENCSR011XCI
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.02 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.03 -0.02 0.04 0.04 0.17 0.13 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.04 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 0.00 0.07 0.10 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.08 0.10 0.00 0.09 0.09 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.12 0.01 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 567 658 3021 628 652 3176 712 3246 806 685 598 507 640 2007 621 3319 573 411 806 501 436 3440 679 248 4096 213 228 2731 2664 3979 3407 4612 4520 94 170 733 180 708 587 624 1674 602 690 740 771 682 683 2029 835 817 ]
C [ 2732 2763 561 575 2750 478 2772 456 325 376 2937 3074 1897 329 385 296 110 194 2691 2900 702 368 59 61 33 9 25 666 1357 216 243 5 14 438 11 234 373 350 548 1924 873 448 470 428 568 2661 1925 494 450 551 ]
G [ 533 570 569 493 506 539 460 533 3038 3066 544 395 437 1767 3200 701 3520 3772 462 318 218 522 3839 4241 361 4310 4105 1169 132 113 839 12 77 124 4371 2905 650 502 511 582 1496 744 2887 2904 2761 535 595 1499 2816 2738 ]
T [ 800 641 481 2936 724 439 688 397 463 505 553 656 1658 529 426 316 429 255 673 913 3276 302 55 82 142 100 274 66 479 324 143 3 21 3976 80 760 3429 3072 2986 1502 589 2838 585 560 532 754 1429 610 531 526 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.02 0.01 0.02 -0.01 -0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.05 0.01 0.05 -0.02 -0.02 0.06 -0.02 0.05 0.05 0.17 0.13 -0.05 -0.01 0.01 -0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
C [ 0.05 0.02 0.02 0.04 0.03 0.01 -0.00 0.03 0.05 0.07 0.05 0.03 -0.03 -0.01 0.01 -0.03 0.08 0.11 0.06 0.03 -0.09 -0.06 0.09 -0.06 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 ]
G [ -0.00 0.01 0.04 0.04 0.06 0.09 0.11 0.04 0.01 0.01 0.05 0.09 0.11 0.08 0.10 0.10 -0.00 -0.02 -0.02 0.02 -0.01 -0.02 -0.01 0.13 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 ]
T [ 0.02 0.03 -0.01 0.00 -0.02 0.00 0.01 0.00 0.04 0.04 -0.00 -0.06 0.00 -0.02 0.02 0.04 -0.03 0.05 0.01 -0.01 -0.06 -0.02 0.04 -0.02 0.03 0.05 0.01 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1734

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 1138

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 762

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 233

CWM

PFM

     

HCWM