Detailed information of deep learning profile BP001329.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF84 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF84
Model ID: BP001329.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0239.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P51523  
Source: ENCSR376UMR
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.02 0.04 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 511 539 182 121 129 182 514 179 145 427 600 618 670 671 400 55 57 59 29 73 557 695 606 300 136 563 65 541 57 42 704 724 37 717 77 495 53 667 113 45 61 69 153 78 538 580 602 595 118 575 ]
C [ 128 85 398 484 492 392 93 70 198 86 40 35 29 23 34 29 19 25 19 591 25 19 45 26 70 38 474 80 10 12 22 10 617 19 14 25 658 29 485 53 41 473 51 568 103 39 43 43 49 49 ]
G [ 52 75 64 51 48 64 65 59 51 85 72 67 40 31 280 28 656 652 690 43 154 20 61 374 511 119 25 43 29 686 12 11 13 10 654 215 14 26 60 45 35 46 48 39 51 85 65 72 529 75 ]
T [ 69 61 116 104 91 122 88 452 366 162 48 40 21 35 46 648 28 24 22 53 24 26 48 60 43 40 196 96 664 20 22 15 93 14 15 25 35 38 102 617 623 172 508 75 68 56 50 50 64 61 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.03 0.03 -0.01 0.03 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.02 0.02 -0.02 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.03 -0.02 -0.02 0.03 -0.01 -0.00 -0.02 0.03 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 0.02 0.04 -0.01 0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.02 0.01 -0.01 0.04 -0.04 -0.02 -0.03 -0.01 0.03 0.03 -0.02 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.02 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.02 0.01 -0.03 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 0.00 -0.00 ]