Detailed information of deep learning profile BP001329.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF84 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF84
Model ID: BP001329.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0239.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P51523  
Source: ENCSR376UMR
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 0.02 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.03 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 61 64 50 50 56 68 75 508 172 623 617 102 38 35 25 15 14 93 15 22 20 664 96 196 40 43 60 48 26 24 53 22 24 28 648 46 35 21 40 48 162 366 452 88 122 91 104 116 61 69 ]
C [ 75 529 72 65 85 51 39 48 46 35 45 60 26 14 215 654 10 13 11 12 686 29 43 25 119 511 374 61 20 154 43 690 652 656 28 280 31 40 67 72 85 51 59 65 64 48 51 64 75 52 ]
G [ 49 49 43 43 39 103 568 51 473 41 53 485 29 658 25 14 19 617 10 22 12 10 80 474 38 70 26 45 19 25 591 19 25 19 29 34 23 29 35 40 86 198 70 93 392 492 484 398 85 128 ]
T [ 575 118 595 602 580 538 78 153 69 61 45 113 667 53 495 77 717 37 724 704 42 57 541 65 563 136 300 606 695 557 73 29 59 57 55 400 671 670 618 600 427 145 179 514 182 129 121 182 539 511 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.03 0.01 -0.02 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.02 0.03 0.03 -0.01 -0.03 -0.02 -0.04 0.04 -0.01 0.01 -0.02 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.01 0.04 0.02 0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.03 -0.02 -0.00 -0.01 0.03 -0.02 -0.02 -0.03 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.02 0.02 -0.02 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.03 -0.01 0.03 0.03 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 ]