Detailed information of deep learning profile BP001322.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF134 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF134
Model ID: BP001322.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0162.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P52741  
Source: ENCSR553NTC
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.06 -0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 0.00 0.04 0.03 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.01 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 830 923 793 1006 1249 786 1556 1504 765 796 765 793 592 596 551 404 587 417 410 523 743 628 1527 675 366 268 2024 3839 258 219 3506 111 438 614 447 2389 1871 527 681 847 827 774 979 1643 1631 1090 1659 978 1471 1636 ]
C [ 1474 924 1417 1474 1067 942 839 855 980 1075 805 673 547 523 587 470 424 472 2440 2530 771 1441 846 1745 2798 966 974 84 401 3584 228 134 487 459 255 1028 772 501 749 1608 1462 846 833 753 837 785 751 737 955 830 ]
G [ 1036 905 1032 912 933 958 984 939 884 1546 920 1873 2423 2503 767 2796 2790 2666 619 627 889 1180 1215 560 387 226 560 163 967 106 150 3834 1659 817 3185 468 746 2807 2193 889 993 955 1189 1026 968 1165 1065 1750 1005 1023 ]
T [ 833 1421 931 781 924 1487 794 875 1544 756 1683 834 611 551 2268 503 372 618 704 493 1770 924 585 1193 622 2713 615 87 2547 264 289 94 1589 2283 286 288 784 338 550 829 891 1598 1172 751 737 1133 698 708 742 684 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 0.00 -0.02 -0.02 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.00 0.02 0.06 -0.01 -0.00 0.04 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.02 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 -0.00 0.01 -0.01 0.01 0.05 0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.02 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.03 0.00 0.04 0.04 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.02 -0.02 0.00 0.06 0.04 0.01 0.04 -0.00 0.00 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.02 -0.00 -0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 -0.01 0.01 0.05 0.00 -0.02 0.03 0.01 -0.02 -0.02 0.02 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 763