Detailed information of deep learning profile BP001321.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF248 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF248
Model ID: BP001321.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0168.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8NDW4  
Source: ENCSR338SEM
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.07 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.07 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.05 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.06 -0.00 0.03 0.02 -0.00 0.00 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 213 231 124 461 456 482 141 483 520 526 89 144 128 528 364 529 84 483 14 583 11 291 2 33 619 2 51 1 5 4 615 4 34 55 610 39 171 126 108 497 517 120 495 183 97 132 446 435 83 421 ]
C [ 242 279 192 62 60 40 94 36 34 12 28 12 22 18 27 11 47 28 225 5 10 217 620 512 1 6 6 38 12 616 8 3 9 1 5 57 59 25 23 24 24 21 36 298 64 277 40 29 83 29 ]
G [ 45 41 43 33 44 53 26 34 31 56 33 419 427 57 198 54 437 101 5 26 52 4 1 2 3 4 566 0 4 0 2 11 571 567 6 13 77 449 459 42 37 424 53 33 24 33 40 83 34 50 ]
T [ 126 75 267 70 66 51 365 73 41 32 476 51 49 23 37 32 58 14 382 12 553 114 3 79 3 614 3 587 605 6 1 608 12 3 5 517 319 26 36 63 48 61 42 112 441 184 100 79 426 126 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.02 -0.00 0.03 -0.02 -0.00 0.05 -0.03 0.01 0.01 0.01 -0.02 0.05 -0.01 -0.01 0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 ]
C [ -0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.02 -0.01 -0.02 -0.01 0.07 0.02 -0.02 0.02 -0.00 -0.02 -0.02 0.07 -0.04 -0.02 0.00 -0.02 -0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.01 0.03 0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.02 -0.00 -0.04 -0.03 0.05 -0.03 -0.02 -0.01 0.01 -0.02 0.04 0.06 -0.01 -0.02 0.01 0.03 0.01 0.00 -0.01 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.02 0.06 -0.04 0.04 0.02 -0.01 -0.04 0.05 -0.01 -0.03 -0.01 0.02 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.00 ]