Detailed information of deep learning profile BP001321.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF248 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF248
Model ID: BP001321.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0168.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8NDW4  
Source: ENCSR338SEM
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 0.02 0.03 -0.00 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.07 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.07 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 126 426 79 100 184 441 112 42 61 48 63 36 26 319 517 5 3 12 608 1 6 605 587 3 614 3 79 3 114 553 12 382 14 58 32 37 23 49 51 476 32 41 73 365 51 66 70 267 75 126 ]
C [ 50 34 83 40 33 24 33 53 424 37 42 459 449 77 13 6 567 571 11 2 0 4 0 566 4 3 2 1 4 52 26 5 101 437 54 198 57 427 419 33 56 31 34 26 53 44 33 43 41 45 ]
G [ 29 83 29 40 277 64 298 36 21 24 24 23 25 59 57 5 1 9 3 8 616 12 38 6 6 1 512 620 217 10 5 225 28 47 11 27 18 22 12 28 12 34 36 94 40 60 62 192 279 242 ]
T [ 421 83 435 446 132 97 183 495 120 517 497 108 126 171 39 610 55 34 4 615 4 5 1 51 2 619 33 2 291 11 583 14 483 84 529 364 528 128 144 89 526 520 483 141 482 456 461 124 231 213 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.02 -0.01 -0.03 -0.01 0.05 -0.04 -0.01 0.02 0.04 -0.04 0.06 -0.02 0.00 -0.01 -0.02 0.02 -0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 -0.01 0.00 0.01 0.03 0.01 -0.02 -0.01 0.06 0.04 -0.02 0.01 -0.01 -0.02 -0.03 0.05 -0.03 -0.04 -0.00 -0.02 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 0.01 0.03 0.01 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.02 -0.02 0.00 -0.02 -0.04 0.07 -0.02 -0.02 -0.00 0.02 -0.02 0.02 0.07 -0.01 -0.02 -0.01 0.02 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.05 -0.02 0.01 0.01 0.01 -0.03 0.05 -0.00 -0.02 0.03 -0.00 0.02 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 ]