Detailed information of deep learning profile BP001317.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZFP64 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZFP64
Model ID: BP001317.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0588.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9NTW7  
Source: ENCSR487CPI
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.04 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.04 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 165 145 163 156 168 161 165 165 162 152 157 167 162 139 167 155 142 160 143 77 137 113 3 3 17 63 9 41 312 241 96 128 258 14 57 299 93 141 166 148 171 174 195 137 173 131 155 147 142 155 ]
C [ 247 256 261 256 250 239 246 254 277 249 255 242 224 235 253 306 336 297 167 150 106 224 791 810 769 93 2 31 166 440 320 493 62 30 428 198 216 234 239 257 199 259 224 269 252 238 257 259 263 277 ]
G [ 257 281 267 270 277 284 287 274 261 271 268 274 299 296 248 244 224 251 459 559 520 448 13 9 4 602 812 741 331 118 87 159 217 762 219 203 186 280 249 244 292 262 246 254 245 292 271 267 250 252 ]
T [ 159 146 137 146 133 144 130 135 128 156 148 145 143 158 160 123 126 120 59 42 65 43 21 6 38 70 5 15 19 29 325 48 291 22 124 128 333 173 174 179 166 133 163 168 158 167 145 155 173 144 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.02 0.02 -0.00 0.01 0.01 -0.02 -0.01 0.02 -0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.04 0.03 0.01 -0.01 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.02 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 0.02 0.04 0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.04 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 0.02 -0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 6081

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 218

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 183

CWM

PFM

     

HCWM