Detailed information of deep learning profile BP001317.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZFP64 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZFP64
Model ID: BP001317.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0588.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9NTW7  
Source: ENCSR487CPI
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.04 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.04 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 144 173 155 145 167 158 168 163 133 166 179 174 173 333 128 124 22 291 48 325 29 19 15 5 70 38 6 21 43 65 42 59 120 126 123 160 158 143 145 148 156 128 135 130 144 133 146 137 146 159 ]
C [ 252 250 267 271 292 245 254 246 262 292 244 249 280 186 203 219 762 217 159 87 118 331 741 812 602 4 9 13 448 520 559 459 251 224 244 248 296 299 274 268 271 261 274 287 284 277 270 267 281 257 ]
G [ 277 263 259 257 238 252 269 224 259 199 257 239 234 216 198 428 30 62 493 320 440 166 31 2 93 769 810 791 224 106 150 167 297 336 306 253 235 224 242 255 249 277 254 246 239 250 256 261 256 247 ]
T [ 155 142 147 155 131 173 137 195 174 171 148 166 141 93 299 57 14 258 128 96 241 312 41 9 63 17 3 3 113 137 77 143 160 142 155 167 139 162 167 157 152 162 165 165 161 168 156 163 145 165 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.01 -0.00 0.01 -0.01 0.02 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.04 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.01 0.01 0.03 0.04 0.03 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.02 -0.01 -0.02 0.01 0.01 -0.00 0.02 0.02 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 6081

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 218

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 183

CWM

PFM

     

HCWM