Detailed information of deep learning profile BP001316.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF664 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF664
Model ID: BP001316.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0647.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8N3J9  
Source: ENCSR714LZQ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.06 0.01 -0.00 0.01 0.07 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 -0.00 0.01 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 1839 2124 2453 3045 2282 2007 1752 3849 3048 1567 3211 3963 3269 1305 3989 295 263 1820 6177 1137 23 678 6825 870 217 6810 1191 629 121 6644 427 554 4825 961 2244 788 1589 1009 1252 4147 1964 1858 1417 3548 1298 1544 1948 1591 1842 1653 ]
C [ 1336 1298 2032 1299 1301 1252 2502 1096 1003 3063 1164 1007 1353 2225 564 530 21 335 481 1706 122 292 101 132 6512 74 3413 4428 54 80 5151 260 456 1062 542 837 774 4408 3542 871 795 1001 3185 1336 3158 1138 1059 1127 1240 2622 ]
G [ 1087 1082 1038 980 1107 1161 959 1037 2050 953 947 1242 1546 787 1424 37 137 65 595 501 114 5942 208 5875 185 351 835 357 35 535 378 244 1020 612 3912 708 3879 709 689 1205 3593 3456 903 1072 903 1082 2597 1344 2152 1165 ]
T [ 3207 2965 1946 2145 2779 3049 2256 1487 1368 1886 2147 1257 1301 3152 1492 6607 7048 5249 216 4125 7210 557 335 592 555 234 2030 2055 7259 210 1513 6411 1168 4834 771 5136 1227 1343 1986 1246 1117 1154 1964 1513 2110 3705 1865 3407 2235 2029 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.05 0.04 0.02 -0.03 0.01 0.05 0.02 0.02 0.05 0.05 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.05 -0.01 0.00 0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.04 -0.02 -0.00 0.02 -0.02 -0.02 0.03 -0.02 -0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 -0.04 -0.01 -0.03 0.02 0.01 -0.01 0.03 -0.02 0.03 0.00 0.01 0.02 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.04 0.06 0.02 -0.01 0.02 0.07 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.00 0.01 0.06 -0.00 0.01 0.04 0.02 0.01 -0.00 0.01 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 12227

CWM

PFM

     

HCWM