Detailed information of deep learning profile BP001316.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF664 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF664
Model ID: BP001316.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0647.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8N3J9  
Source: ENCSR714LZQ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.04 0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.07 0.01 -0.00 0.01 0.06 0.04 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2029 2235 3407 1865 3705 2110 1513 1964 1154 1117 1246 1986 1343 1227 5136 771 4834 1168 6411 1513 210 7259 2055 2030 234 555 592 335 557 7210 4125 216 5249 7048 6607 1492 3152 1301 1257 2147 1886 1368 1487 2256 3049 2779 2145 1946 2965 3207 ]
C [ 1165 2152 1344 2597 1082 903 1072 903 3456 3593 1205 689 709 3879 708 3912 612 1020 244 378 535 35 357 835 351 185 5875 208 5942 114 501 595 65 137 37 1424 787 1546 1242 947 953 2050 1037 959 1161 1107 980 1038 1082 1087 ]
G [ 2622 1240 1127 1059 1138 3158 1336 3185 1001 795 871 3542 4408 774 837 542 1062 456 260 5151 80 54 4428 3413 74 6512 132 101 292 122 1706 481 335 21 530 564 2225 1353 1007 1164 3063 1003 1096 2502 1252 1301 1299 2032 1298 1336 ]
T [ 1653 1842 1591 1948 1544 1298 3548 1417 1858 1964 4147 1252 1009 1589 788 2244 961 4825 554 427 6644 121 629 1191 6810 217 870 6825 678 23 1137 6177 1820 263 295 3989 1305 3269 3963 3211 1567 3048 3849 1752 2007 2282 3045 2453 2124 1839 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.02 0.04 0.01 -0.00 0.06 0.01 0.00 0.03 0.02 0.03 0.01 0.03 0.07 0.02 -0.01 0.02 0.06 0.04 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.03 -0.02 0.03 -0.01 0.01 0.02 -0.03 -0.01 -0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.02 0.03 -0.02 -0.02 0.02 -0.00 -0.02 0.04 -0.01 0.01 -0.01 0.01 0.01 0.00 -0.01 -0.05 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.06 0.01 0.02 0.05 0.05 0.02 0.02 0.05 0.01 -0.03 0.02 0.04 0.05 0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 12227

CWM

PFM

     

HCWM