Detailed information of deep learning profile BP001314.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF449 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF449
Model ID: BP001314.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1656.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P9G9  
Source: ENCSR738SLS
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.06 0.00 -0.00 0.06 0.08 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.03 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2788 2779 2558 2523 2972 2830 2666 2737 2436 2593 3008 3094 3123 3045 2484 2004 2323 1638 170 88 579 73 21 147 78 1880 485 2133 2008 1823 2189 2364 2156 2239 2234 2511 2172 2278 2192 2210 2368 2346 2243 2706 2726 2199 2344 2339 2311 2700 ]
C [ 3240 2857 3557 3795 3088 2861 3022 2726 2918 2913 2533 2743 3114 2600 3265 3948 2771 612 109 3848 565 89 30 1750 11229 474 3646 2743 2533 4514 3433 2795 3367 3023 3433 2941 3179 2984 3492 3620 2928 2805 2963 3009 2981 2934 3336 3420 3436 2954 ]
G [ 3093 3406 3037 2923 2906 3198 3271 3232 3212 3018 2865 3240 3028 2826 3168 3184 2075 7557 11030 94 1095 11029 11350 9365 46 2231 3195 3838 4522 2416 3048 3670 3169 3387 3121 3367 3345 3662 3264 3175 3168 3859 3325 3177 3137 3295 3301 3092 3198 3105 ]
T [ 2302 2381 2271 2182 2457 2534 2464 2728 2857 2899 3017 2346 2158 2952 2506 2287 4254 1616 114 7393 9184 232 22 161 70 6838 4097 2709 2360 2670 2753 2594 2731 2774 2635 2604 2727 2499 2475 2418 2959 2413 2892 2531 2579 2995 2442 2572 2478 2664 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.02 -0.03 -0.01 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 -0.01 -0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.01 0.02 0.01 -0.01 0.03 0.01 0.00 -0.01 0.02 0.08 -0.00 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.06 -0.03 0.00 0.06 0.08 0.05 -0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
T [ 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.05 0.03 -0.02 -0.03 -0.02 -0.02 0.02 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1750

CWM

PFM

     

HCWM