Detailed information of deep learning profile BP001314.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF449 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF449
Model ID: BP001314.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1656.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P9G9  
Source: ENCSR738SLS
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 0.04 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.08 0.06 -0.00 0.00 0.06 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2664 2478 2572 2442 2995 2579 2531 2892 2413 2959 2418 2475 2499 2727 2604 2635 2774 2731 2594 2753 2670 2360 2709 4097 6838 70 161 22 232 9184 7393 114 1616 4254 2287 2506 2952 2158 2346 3017 2899 2857 2728 2464 2534 2457 2182 2271 2381 2302 ]
C [ 3105 3198 3092 3301 3295 3137 3177 3325 3859 3168 3175 3264 3662 3345 3367 3121 3387 3169 3670 3048 2416 4522 3838 3195 2231 46 9365 11350 11029 1095 94 11030 7557 2075 3184 3168 2826 3028 3240 2865 3018 3212 3232 3271 3198 2906 2923 3037 3406 3093 ]
G [ 2954 3436 3420 3336 2934 2981 3009 2963 2805 2928 3620 3492 2984 3179 2941 3433 3023 3367 2795 3433 4514 2533 2743 3646 474 11229 1750 30 89 565 3848 109 612 2771 3948 3265 2600 3114 2743 2533 2913 2918 2726 3022 2861 3088 3795 3557 2857 3240 ]
T [ 2700 2311 2339 2344 2199 2726 2706 2243 2346 2368 2210 2192 2278 2172 2511 2234 2239 2156 2364 2189 1823 2008 2133 485 1880 78 147 21 73 579 88 170 1638 2323 2004 2484 3045 3123 3094 3008 2593 2436 2737 2666 2830 2972 2523 2558 2779 2788 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.02 -0.02 -0.02 -0.03 -0.02 0.03 0.05 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.03 -0.02 0.05 0.08 0.06 0.00 -0.03 0.06 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 -0.00 0.08 0.02 -0.01 0.00 0.01 0.03 -0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.02 -0.01 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.01 -0.03 -0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1750

CWM

PFM

     

HCWM