Detailed information of deep learning profile BP001309.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF16 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF16
Model ID: BP001309.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1654.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P17020  
Source: ENCSR093HXE
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.01 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.05 0.01 0.05 0.03 0.04 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.05 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 ]

Frequency matrix

       
A [ 20 23 14 12 21 7 27 8 6 16 10 12 11 10 28 0 5 2 5 6 2 6 7 1 2 0 31 49 33 39 42 2 9 7 6 9 20 40 4 10 1 5 1 4 8 6 14 37 2 5 ]
C [ 27 25 18 46 17 30 13 31 43 30 19 10 13 44 33 49 4 71 36 53 33 21 19 74 1 74 29 14 10 22 13 55 57 23 28 54 37 7 5 1 11 63 9 61 60 62 25 20 27 8 ]
G [ 10 16 8 5 5 24 11 16 11 10 12 38 19 9 3 3 23 0 1 4 2 4 46 0 0 1 0 5 23 9 7 2 4 4 6 4 7 21 9 62 58 0 2 4 4 0 6 10 20 16 ]
T [ 18 11 35 12 32 14 24 20 15 19 34 15 32 12 11 23 43 2 33 12 38 44 3 0 72 0 15 7 9 5 13 16 5 41 35 8 11 7 57 2 5 7 63 6 3 7 30 8 26 46 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.02 0.02 0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.02 0.01 -0.02 -0.02 -0.01 0.00 -0.01 0.02 0.02 -0.01 -0.01 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 -0.00 0.03 0.02 0.03 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.00 -0.01 0.05 -0.01 0.05 0.04 0.05 0.00 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.02 -0.01 -0.00 -0.01 0.02 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 0.03 0.05 -0.02 0.02 -0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 ]
T [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.00 0.04 0.00 -0.01 0.01 0.05 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 0.00 0.02 0.02 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 1534

CWM

PFM

     

HCWM