Detailed information of deep learning profile BP001307.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF211 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF211
Model ID: BP001307.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: MA1974.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q13398  
Source: ENCSR365DQH
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.04 -0.00 0.04 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.04 0.00 0.04 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 393 432 437 534 395 410 368 448 355 368 371 487 442 440 482 502 88 885 18 1084 19 1084 28 69 994 108 429 243 440 611 681 203 679 457 453 491 526 365 288 534 497 456 529 501 607 459 450 341 320 369 ]
C [ 202 197 215 196 176 193 247 246 193 200 193 194 175 157 253 110 233 104 59 6 34 20 1063 927 45 391 252 366 104 188 117 603 161 255 175 165 156 200 357 166 183 158 187 188 150 197 170 231 244 166 ]
G [ 198 154 141 118 243 252 220 160 127 266 286 231 278 255 125 181 209 88 9 11 9 13 10 2 36 71 232 81 56 104 137 92 84 101 124 273 186 192 125 194 167 142 157 196 116 142 151 292 143 250 ]
T [ 324 334 324 269 303 262 282 263 442 283 267 205 222 265 257 324 587 40 1031 16 1055 0 16 119 42 547 204 427 517 214 182 219 193 304 365 188 249 360 347 223 270 361 244 232 244 319 346 253 410 332 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.01 0.02 -0.02 0.04 -0.01 0.04 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.02 -0.00 -0.00 0.04 0.03 -0.00 0.02 0.02 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.01 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.00 ]
T [ 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 -0.01 0.04 -0.02 0.04 -0.03 0.00 0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 68