Detailed information of deep learning profile BP001300.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF529 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF529
Model ID: BP001300.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0626.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P280  
Source: ENCSR754SOI
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 0.05 0.02 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.05 0.06 0.07 0.08 0.01 0.00 0.03 -0.00 0.00 0.07 0.04 0.01 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.05 0.02 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 175 370 403 209 380 137 158 119 138 382 227 108 380 113 72 212 15 49 14 11 482 524 292 63 109 16 18 353 25 225 621 504 27 181 135 77 454 120 392 158 229 182 188 386 226 120 106 109 121 129 ]
C [ 169 99 86 78 74 109 67 115 99 71 243 475 153 146 110 11 11 8 9 3 26 20 17 603 41 13 61 14 124 28 64 30 17 11 19 169 107 294 88 200 70 76 71 103 195 295 153 325 133 276 ]
G [ 111 129 144 330 144 106 372 118 128 137 82 48 58 64 53 421 596 635 668 702 173 135 397 40 90 685 618 334 67 452 13 112 621 494 522 71 83 60 125 117 314 367 357 127 105 103 109 100 118 148 ]
T [ 267 124 89 105 124 370 125 370 357 132 170 91 131 399 487 78 100 30 31 6 41 43 16 16 482 8 25 21 506 17 24 76 57 36 46 405 78 248 117 247 109 97 106 106 196 204 354 188 350 169 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 0.02 -0.02 -0.01 -0.03 -0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.00 -0.01 -0.03 0.06 -0.03 0.03 0.05 0.03 -0.01 0.03 0.01 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.03 -0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.07 0.04 0.02 0.06 0.00 0.06 0.01 0.03 0.01 0.02 -0.00 -0.00 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.02 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.04 0.05 0.07 0.07 0.08 0.06 0.03 0.06 0.01 0.04 0.07 0.05 0.03 -0.00 0.04 -0.04 0.02 0.05 0.03 0.04 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 ]
T [ 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.02 -0.00 0.01 0.00 0.01 -0.03 0.04 -0.02 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 621

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 267

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 208

CWM

PFM

     

HCWM