Detailed information of deep learning profile BP001300.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF529 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF529
Model ID: BP001300.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0626.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P280  
Source: ENCSR754SOI
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.02 0.05 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.01 0.04 0.07 0.00 -0.00 0.03 0.00 0.01 0.08 0.07 0.06 0.05 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.05 0.01 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 169 350 188 354 204 196 106 106 97 109 247 117 248 78 405 46 36 57 76 24 17 506 21 25 8 482 16 16 43 41 6 31 30 100 78 487 399 131 91 170 132 357 370 125 370 124 105 89 124 267 ]
C [ 148 118 100 109 103 105 127 357 367 314 117 125 60 83 71 522 494 621 112 13 452 67 334 618 685 90 40 397 135 173 702 668 635 596 421 53 64 58 48 82 137 128 118 372 106 144 330 144 129 111 ]
G [ 276 133 325 153 295 195 103 71 76 70 200 88 294 107 169 19 11 17 30 64 28 124 14 61 13 41 603 17 20 26 3 9 8 11 11 110 146 153 475 243 71 99 115 67 109 74 78 86 99 169 ]
T [ 129 121 109 106 120 226 386 188 182 229 158 392 120 454 77 135 181 27 504 621 225 25 353 18 16 109 63 292 524 482 11 14 49 15 212 72 113 380 108 227 382 138 119 158 137 380 209 403 370 175 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.02 0.04 -0.03 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.02 -0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 ]
C [ 0.01 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.04 0.03 0.05 0.02 -0.04 0.04 -0.00 0.03 0.05 0.07 0.04 0.01 0.06 0.03 0.06 0.08 0.07 0.07 0.05 0.04 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 -0.00 -0.00 0.02 0.01 0.03 0.01 0.06 0.00 0.06 0.02 0.04 0.07 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 -0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.01 0.03 -0.01 0.03 0.05 0.03 -0.03 0.06 -0.03 -0.01 0.00 0.01 0.03 0.02 0.02 -0.02 -0.03 -0.01 -0.02 0.02 0.00 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 621

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 267

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 208

CWM

PFM

     

HCWM