Detailed information of deep learning profile BP001294.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF462 in GM23338 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF462
Model ID: BP001294.1
Cell line/tissue: GM23338
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0616.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q96JM2  
Source: ENCSR334UWP
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.02 0.03 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 750 745 744 727 775 768 717 764 776 807 800 769 757 751 690 864 807 885 957 806 646 912 547 273 677 62 66 567 344 236 835 108 1003 302 988 835 638 742 819 786 833 863 830 832 853 843 822 804 764 847 ]
C [ 706 721 725 755 713 685 711 663 680 665 723 676 738 759 884 698 698 628 545 560 575 460 1376 1740 858 2508 2848 159 280 2091 54 33 142 390 772 656 764 850 696 697 618 611 604 632 696 710 703 690 759 705 ]
G [ 719 731 686 703 689 679 676 686 714 677 635 693 617 673 635 525 704 675 755 847 1021 1172 353 297 225 57 19 22 2092 317 305 2770 1283 1814 646 689 792 559 587 731 667 639 773 753 660 659 687 663 707 662 ]
T [ 805 783 825 795 803 848 876 867 810 831 822 842 868 797 771 893 771 792 723 767 738 436 704 670 1220 353 47 2232 264 336 1786 69 552 474 574 800 786 829 878 766 862 867 773 763 771 768 768 823 750 766 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 3150

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 1968

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 823

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 489

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 411

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 196

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 137

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_8

Num. of seqlets: 107

CWM

PFM

     

HCWM