Detailed information of deep learning profile BP001294.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF462 in GM23338 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF462
Model ID: BP001294.1
Cell line/tissue: GM23338
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0616.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q96JM2  
Source: ENCSR334UWP
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.02 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.02 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 766 750 823 768 768 771 763 773 867 862 766 878 829 786 800 574 474 552 69 1786 336 264 2232 47 353 1220 670 704 436 738 767 723 792 771 893 771 797 868 842 822 831 810 867 876 848 803 795 825 783 805 ]
C [ 662 707 663 687 659 660 753 773 639 667 731 587 559 792 689 646 1814 1283 2770 305 317 2092 22 19 57 225 297 353 1172 1021 847 755 675 704 525 635 673 617 693 635 677 714 686 676 679 689 703 686 731 719 ]
G [ 705 759 690 703 710 696 632 604 611 618 697 696 850 764 656 772 390 142 33 54 2091 280 159 2848 2508 858 1740 1376 460 575 560 545 628 698 698 884 759 738 676 723 665 680 663 711 685 713 755 725 721 706 ]
T [ 847 764 804 822 843 853 832 830 863 833 786 819 742 638 835 988 302 1003 108 835 236 344 567 66 62 677 273 547 912 646 806 957 885 807 864 690 751 757 769 800 807 776 764 717 768 775 727 744 745 750 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 3150

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 1968

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 823

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 489

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 411

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 196

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 137

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_8

Num. of seqlets: 107

CWM

PFM

     

HCWM