Detailed information of deep learning profile BP001289.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for HSF1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: HSF1
Model ID: BP001289.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: Heat shock factors
Family: HSF factors
JASPAR ID: MA0486.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10961  
Source: ENCSR062HDL
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 137 141 116 137 140 131 126 126 135 158 117 127 118 74 152 86 275 7 519 474 115 121 35 17 0 7 370 0 467 407 151 136 125 112 92 93 141 132 146 147 130 139 124 99 127 121 118 130 114 140 ]
C [ 155 144 162 158 172 142 140 154 154 133 158 169 116 167 226 167 34 3 18 26 190 177 31 7 573 220 26 5 38 47 139 163 115 105 256 184 132 121 142 154 166 156 163 177 164 161 172 163 154 158 ]
G [ 147 156 188 149 155 162 171 209 153 170 158 156 161 146 116 126 248 562 23 32 153 161 17 33 3 19 174 567 46 59 199 176 121 161 133 143 166 203 175 154 152 162 159 161 157 147 166 165 174 155 ]
T [ 137 135 110 132 109 141 139 87 134 115 143 124 181 189 82 197 19 4 16 44 118 117 493 519 0 330 6 4 25 63 87 101 215 198 95 156 137 120 113 121 128 119 130 139 128 147 120 118 134 123 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 0.01 -0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.02 -0.01 0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001288.1 HSF1 ENCSR000EET HepG2 Homo sapiens MA0486.2
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