Detailed information of deep learning profile BP001289.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for HSF1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: HSF1
Model ID: BP001289.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: Heat shock factors
Family: HSF factors
JASPAR ID: MA0486.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10961  
Source: ENCSR062HDL
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 123 134 118 120 147 128 139 130 119 128 121 113 120 137 156 95 198 215 101 87 63 25 4 6 330 0 519 493 117 118 44 16 4 19 197 82 189 181 124 143 115 134 87 139 141 109 132 110 135 137 ]
C [ 155 174 165 166 147 157 161 159 162 152 154 175 203 166 143 133 161 121 176 199 59 46 567 174 19 3 33 17 161 153 32 23 562 248 126 116 146 161 156 158 170 153 209 171 162 155 149 188 156 147 ]
G [ 158 154 163 172 161 164 177 163 156 166 154 142 121 132 184 256 105 115 163 139 47 38 5 26 220 573 7 31 177 190 26 18 3 34 167 226 167 116 169 158 133 154 154 140 142 172 158 162 144 155 ]
T [ 140 114 130 118 121 127 99 124 139 130 147 146 132 141 93 92 112 125 136 151 407 467 0 370 7 0 17 35 121 115 474 519 7 275 86 152 74 118 127 117 158 135 126 126 131 140 137 116 141 137 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 0.01 -0.01 0.02 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001288.1 HSF1 ENCSR000EET HepG2 Homo sapiens MA0486.2
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