Detailed information of deep learning profile BP001276.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for THAP1 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: THAP1
Model ID: BP001276.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2CH THAP-type zinc finger factors
Family: THAP-related factors
JASPAR ID: MA0597.3
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9NVV9  
Source: ENCSR000BNN
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.04 0.00 -0.00 0.01 0.07 0.06 -0.00 0.07 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.11 0.13 0.05 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.03 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.09 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.11 0.09 0.00 0.03 0.02 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.01 0.01 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 85 86 87 98 92 102 106 101 109 101 73 79 67 88 63 36 35 29 17 3 117 106 66 278 138 39 160 379 357 75 401 6 2 15 43 50 75 44 90 114 83 94 80 55 77 77 68 98 65 74 ]
C [ 141 137 159 146 137 131 120 134 128 130 128 132 179 137 126 212 94 18 407 439 307 37 158 77 87 227 201 9 26 116 19 10 4 10 359 88 83 292 149 99 171 127 106 179 125 108 195 128 157 159 ]
G [ 135 133 132 132 135 140 150 125 137 135 158 157 117 93 110 61 31 364 18 9 21 168 97 31 90 50 40 48 32 227 15 31 443 410 16 233 249 77 136 171 132 164 199 139 141 150 109 118 141 120 ]
T [ 93 98 76 78 90 81 78 94 80 88 95 86 91 136 155 145 294 43 12 3 9 143 133 68 139 138 53 18 39 36 19 407 5 19 36 83 47 41 79 70 68 69 69 81 111 119 82 110 91 101 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 -0.00 -0.01 -0.03 -0.04 -0.02 -0.03 -0.07 0.04 0.01 -0.01 0.06 0.02 -0.02 0.02 0.08 0.06 -0.01 0.07 -0.06 -0.05 -0.03 -0.03 -0.02 -0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.02 0.00 0.00 0.03 0.03 -0.07 0.11 0.13 0.07 -0.07 0.03 -0.00 -0.01 0.02 0.02 -0.06 -0.02 0.01 -0.03 -0.01 -0.04 -0.03 0.09 -0.01 -0.00 0.04 0.00 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.02 0.10 -0.03 0.02 -0.03 0.06 -0.00 -0.04 -0.01 -0.02 -0.02 0.01 -0.03 0.03 -0.03 -0.00 0.11 0.09 -0.06 0.04 0.04 -0.01 0.01 ]
T [ -0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 -0.02 -0.06 -0.11 -0.08 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.09 -0.03 -0.03 -0.02 -0.02 -0.03 -0.03 -0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 843

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 706

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 67

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_8

Num. of seqlets: 31

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_9

Num. of seqlets: 27

CWM

PFM

     

HCWM